私募基金.牌照保壳计划失败后，管理人是有权进行申诉的。申诉的过程通常涉及对监管机构的决策提出异议，并请求重新评估或给出更详细的解释。

申诉的具体流程可能因地区和监管机构的不同而有所差异。一般来说，申诉可能需要提交一份详细的申诉书，其中应包含对原决策的异议、相关证据以及支持申诉的理由。这些证据可能包括业务运营记录、合规文件、内部风险控制措施等，用以证明管理人在运营过程中是合规的，或者原决策存在不当之处。

提交申诉后，监管机构会对申诉进行审查。审查期间，监管机构可能会要求管理人提供更多信息或进行进一步解释。审查结束后，监管机构会作出新的决策，该决策可能是维持原决定，也可能是部分或全部接受管理人的申诉。

需要注意的是，申诉并不意味着一定能够成功推翻原决策。因此，在申诉之前，管理人应仔细评估自身的情况和证据，确保申诉的合理性和有效性。同时，管理人还应了解并遵守相关的申诉规定和流程，以确保申诉的顺利进行。

此外，如果申诉未能成功，管理人还可以考虑寻求其他法律途径，如行政复议或诉讼等，以维护自身权益。但需要注意的是，这些途径可能需要更多的时间和资源投入，并且结果也存在不确定性。

私募基金.牌照保壳计划失败后，管理人有权进行申诉，但应确保申诉的合理性和有效性，并遵守相关的规定和流程。同时，管理人还应积极寻求其他合法途径来维护自身权益。